Для того чтоб сменить пароль mysql по ssh нужно в консоли залогиниться под любым пользователем с административными правами

mysql -u root если вы только установили mysql и пароль не задан или

mysql -u root -p если пароль задан, далее потребуется ввести пароль.

Cменить пароль любому пользователю можно следующим запросом

UPDATE mysql.user SET Password=PASSWORD('MyNewPass') WHERE User='root';
FLUSH PRIVILEGES;