Как быстро очистить все таблицы в базе?

SELECT Concat('TRUNCATE TABLE ',table_schema,'.',TABLE_NAME, ';') 
FROM INFORMATION_SCHEMA.TABLES where  table_schema in ('db1_name','db2_name');

Выполните этот запрос и получите список запросов для очистки каждой таблицы. Далее просто скопируйте его и выполните.